{"id":12299,"date":"2023-11-09T10:02:54","date_gmt":"2023-11-09T09:02:54","guid":{"rendered":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/?p=12299"},"modified":"2023-11-09T10:02:54","modified_gmt":"2023-11-09T09:02:54","slug":"soutenance-de-these-35","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/2023\/11\/09\/soutenance-de-these-35\/","title":{"rendered":"Soutenance de th\u00e8se"},"content":{"rendered":"

Titre<\/strong> : Exp\u00e9riences et simulations pour comprendre l’\u00e9coulement pilot\u00e9 par les cils et leur r\u00f4le protecteur sur les embryons de Xenopus<\/span><\/p>\n

R\u00e9sum\u00e9 :<\/strong><\/p>\n

Les cils sont de petits appendices ressemblant \u00e0 des cheveux que l’on trouve sur les cellules multicili\u00e9es (MCC) de nombreux \u00e9pith\u00e9liums de syst\u00e8mes vivants, des micro-organismes aux organes des mammif\u00e8res. Leur battement synchronis\u00e9 sur de grandes \u00e9chelles spatiales est essentiel pour des fonctions critiques telles que la nage chez les micro-organismes, la circulation du liquide c\u00e9phalo-rachidien dans le cerveau et l’\u00e9limination du mucus dans les voies respiratoires. La surface de l’embryon de grenouille Xenopus laevis pr\u00e9sente aussi des MCC, r\u00e9parties spatialement de mani\u00e8re r\u00e9guli\u00e8re, qui disparaissent ensuite lorsque l’embryon atteint le stade de la maturit\u00e9. Au d\u00e9but du d\u00e9veloppement de l\u2019embryon, on pense que le flux g\u00e9n\u00e9r\u00e9 par les cils est essentiel pour les \u00e9changes gazeux respiratoires. Cependant, la pr\u00e9sence continue des cils apr\u00e8s ces \u00e9tapes sugg\u00e8re qu’ils peuvent avoir d’autres fonctions, telles que l’\u00e9limination des agents pathog\u00e8nes. Nous avons \u00e9mis l’hypoth\u00e8se que la r\u00e9partition spatiale r\u00e9guli\u00e8re des MCC observ\u00e9e sur l\u2019\u00e9pith\u00e9lium pourrait \u00eatre optimis\u00e9e pour l’\u00e9limination des agents pathog\u00e8nes.<\/span><\/p>\n

Pour \u00e9tudier cette hypoth\u00e8se, nous avons combin\u00e9 des techniques biologiques exp\u00e9rimentales : modification de la distribution spatiale des MCC induite par une drogue, d\u00e9veloppement d’une culture d’explants ex-vivo, microscopie optique et de fluorescence, vid\u00e9omicroscopie, v\u00e9locim\u00e9trie par image de particules, traitement et analyse d’images, et simulations bas\u00e9es sur un mod\u00e8le num\u00e9rique 3D utilisant la m\u00e9thode de Lattice Boltzmann. Nous avons caract\u00e9ris\u00e9 la r\u00e9partition spatiale des MCC \u00e0 la surface des embryons et des explants et mesur\u00e9 les \u00e9coulements 3D sur les explants avec diff\u00e9rentes distributions spatiales du MCC. Nous avons valid\u00e9 le code num\u00e9rique en comparant les \u00e9coulements g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par les cils calcul\u00e9s avec ceux mesur\u00e9s exp\u00e9rimentalement sur les explants. Enfin, nous avons calcul\u00e9 num\u00e9riquement les \u00e9coulements g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par les cils sur les flancs des embryons et \u00e9tudi\u00e9 le r\u00f4le de diff\u00e9rentes r\u00e9partitions spatiales et densit\u00e9s de MCC sur les infections bact\u00e9riennes. Nous avons montr\u00e9 que les \u00e9coulements g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par les cils prot\u00e8gent efficacement les flancs des embryons des infections bact\u00e9riennes, ind\u00e9pendamment des modifications de la r\u00e9partition spatiale des cils. Les bact\u00e9ries ne peuvent acc\u00e9der \u00e0 l’\u00e9pith\u00e9lium que si de larges zones sont d\u00e9pourvues de cellules cili\u00e9es. Cela sugg\u00e8re que la r\u00e9partition r\u00e9guli\u00e8re des MCC sur l’\u00e9pith\u00e9lium n\u2019est pas directement li\u00e9e \u00e0 la clairance des pathog\u00e8nes.<\/p>\n

Membres du jury :<\/strong><\/p>\n

Xavier Noblin:\u00a0 <\/b>
\nReviewer\u00a0 , Universit\u00e9 C\u00f4te d’Azur, Institut de Physique de Nice (INPHYNI)<\/i>
\n\u00a0Peter Walentek :<\/b>
\nReviewer, University Freiburg Clinical Cente, Germany<\/i>
\nOlivia du Roure\u00a0\u00a0 :<\/b>
\nPresident, Physique et M\u00e9canique des Milieux H\u00e9t\u00e9rog\u00e8nes, <\/i>ESPCI, <\/i>Paris<\/i><\/div>\n
Alessandro Bottaro: \u00a0<\/b>
\nExaminer , Universit\u00e0\u00a0 di Genova, Italia<\/i>
\nAnnie Viallat : <\/b>
\nPhD Supervisor, Centre Interdisciplinaire de Nanoscience de Marseille , CINaM, Marseille<\/i>
\nLaurent Kodjabachian: <\/b>
\nPhD Supervisor, Institut de Biologie du D\u00e9veloppement de Marseille, IBDM , Marseille<\/i>
\nJulien Favier: <\/b>
\nPhD co-supervisor, Laboratoire de M\u00e9canique, Mod\u00e9lisation et Proc\u00e9d\u00e9s Propres M2P2, Marseille<\/i><\/div>\n

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Athullya Baby soutiendra le lundi 13 novembre \u00e0 11 heures \u00e0 l’Auditorium de l’Hexagone sur le Campus de Luminy<\/p>\n","protected":false},"author":16,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[1],"tags":[],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12299"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/users\/16"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=12299"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12299\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":12301,"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12299\/revisions\/12301"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=12299"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=12299"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cinam.univ-mrs.fr\/cinam\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=12299"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}